據臺灣《旺報》報道，對於菲國公務船濫殺臺灣漁民一事，引發大陸強烈關注。大陸學者發現，臺灣方面在海洋權益的維護上，能力走向日薄西山，兩岸應共同合作，進行海洋維權。
中國人民大學國際關係學院教授時殷弘指出，菲國的蠻橫作為引起兩岸極大憤怒，只會惡化菲國和兩岸的關係，最後促成兩岸加大對菲國在海洋權益上的鬥爭力度。
華東師範大學國際關係與地區發展研究院副教授包承柯說，即便臺灣軍事力量維持在一定水準上，但再過10年，臺灣應變海洋緊急態勢的能力在下降；海洋管理維權能力也在削弱，如此一來，臺灣當局如何維護海洋經濟權？他說，冷戰時期，該區域的海洋紛爭都是靠美國來做調解，但未來的區域經濟權利問題上，美國未必介入。
包承柯建議，大陸和臺灣可以在海洋維權的問題上，達成一些合作或共識，如此正好能彌補臺灣在處理海洋管理問題上不足的需求。
