據介紹，2012年廈門檢驗檢疫局深化對臺灣地區輸大陸甲魚卵實行產地養殖場註冊和對臺灣地區輸大陸水果果園、加工場實行註冊備案等先行先試措施。全年共進口臺灣水果7980噸，比增12．6％，廈門口岸連續5年保持臺灣地區水果輸大陸最大口岸。2012年6月大陸開放臺灣大米進口後，廈門口岸目前已進口臺灣大米525噸，成為臺灣地區大米輸大陸最大口岸。
此外，2012年，廈門檢驗檢疫局共簽發ECFA（兩岸經濟合作框架協議）原產地證書950份，佔福建全省的62％，貨值2166萬美元。
廈門檢驗檢疫局局長詹思明表示，2013年該局將推廣臺灣水果、甲魚卵及其他農產品檢驗檢疫經驗，在風險分析的基礎上，探索認可臺灣方面檢測結果，開展果園和觀賞魚基地註冊等對臺動植物監管新模式。（項開來）
