《平潭綜合實驗區總體規劃》的規劃範圍為原平潭縣15個鄉鎮所轄行政區域，規劃陸域面積392.92平方公里，其中主島面積324.13平方公里。

　　主島規劃四區十一組團

　　島內開發建設採取組團推進、分時序開發的空間發展模式，構建“四區、十一組團”。

　　位於主島中部的中心商務區，包括嵐城組團、竹嶼組團、潭城組團。其中，嵐城組團、竹嶼組團定位發展商務會展、金融保險、行政辦公、酒店餐飲、購物休閒、生活居住等；潭城組團，即現有老城區，重點改造提升城區市政設施，定位為發展商貿服務、教育醫療、生活居住、旅遊服務等功能。

　　位於主島西南、東南部的港口經貿區，包括金井灣組團、吉釣港組團、澳前組團。其中，金井灣組團規劃建設臺灣購物街、臺灣精品免稅街、臺灣飲食街及景觀商務區、水景住宅等，打造具有臺灣特色的高品質濱海商貿區；吉釣港組團以對臺深水貨運碼頭為依託，規劃設立國家一類開放口岸及海關特殊監管區域，發展港口航運、保稅加工、保稅物流、貨運代理、轉口貿易等；澳前組團規劃面積5平方公里，以對臺客運碼頭、中心漁港為依託，主要發展綜合商貿、水產品深加工及臺灣特色農產品交易中心等。

　　位於主島中北部的科技文教區，包括中原組團、平洋組團、幸福洋組團。其中，中原組團主要發展電子資訊、海洋生物、清潔能源、高端機械裝備等高新技術產業；平洋組團重點發展高等教育、職業技術教育培訓、產業研發等；幸福洋組團主要發展服務高新技術產業、體現“智慧”特色、“智慧”經濟的濱海新區，建設兩岸合作的“低碳智慧”示範城市。

　　主要位於主島東南部海岸及鄰近島礁和海域的旅遊休閒區，包括壇南灣組團、海壇灣組團。其中，壇南灣組團開發建設高水準國際旅遊精品及觀光休閒養生景區，佈局發展高品質度假酒店、國際養生村、沙灘俱樂部、海洋主題公園、休閒度假樂園等，打造高端國際養生度假區；海壇灣組團依託天然海濱沙灘、國家級森林公園，打造高層次的海濱觀光勝地和公眾休閒活動區。

　　此外，嶼頭島初步定位發展高尚住宅區及生態國際村；大練島初步定位發展船舶產業島；東庠島初步定位發展海洋牧場島；草嶼島初步定位發展海上補給基地；塘嶼島初步定位發展高端國際度假島。　

　　發展四大產業

　　未來平潭將發展四大產業。一是高新技術產業，重點發展電子資訊、高端機械裝備、清潔能源等高新技術產業。

　　二是海洋產業，重點發展海洋生物、水產加工、精緻農漁業、特色船舶修造。三是旅遊業，重點發展濱海度假、文化旅遊、旅遊購物、休閒養生等。四是現代服務業，重點發展商貿流通、金融保險、研發會展等服務業。

　　交通網路立體化

　　根據規劃，未來平潭對外交通重點建設漁（溪）平（潭）高速公路、平潭海峽大橋（含復橋）、長（樂）平（潭）高速公路和福（州）平（潭）高速鐵路。

　　內部交通總體形成“一環兩縱三橫”的主幹路網骨架。“一環”為環島路，按一級公路標準設計；“兩縱”為南北向的壇東、壇西大道；“三橫”分別為漁平大道、蘇平大道和福平大道。“兩縱三橫”規劃為城市快速路。主島內中遠期規劃軌道交通系統，串聯城市各片區及相關組團。

　　規劃在實驗區設置支線機場，初步選定澳前鎮東側為備選場址。