據臺灣“今日新聞網”報道，臺“總統府”29日晚間指出，陳水扁辦公室等17個辦公室，收文共38924件，僅2568件歸檔，10958件不知去向，全案送請臺“監察院”查辦。對此，國民黨“立委”邱毅30日表示，“我覺得‘總統府’移送陳水扁等人，是移送的好，移送的還晚了，應該把陳水扁偵查起訴”。
邱毅表示，在陳水扁下臺之前，曾經傳出“總統府”買了一堆碎紙機，當時“總統府”還嚴詞否認，質疑是“烏龍爆料”。他表示，現在證明當時買一堆碎紙機的目的，就是為了湮滅重要的機密文件。
邱毅指出，陳水扁在任內貪污洗錢無惡不做，又淹滅了重要證據，甚至還夾帶了許多“外交”的機密，想要把這些重要證據，當作貪污洗錢未來東窗事發的跟當局要挾、談判的工具。
邱毅表示，更可惡的是當初買碎紙機，湮滅證據的時候，“總統府”被揭穿，“還不要臉地說沒有這回事”。
他強調，覺得“總統府”移送陳水扁等人，是移送得好，移送得還晚了，應該把陳水扁以“妨害‘國家’機密保護法”跟“檔案法”等，把陳水扁偵查起訴。
