著名的兩岸問題專家、廈門大學臺灣研究所教授陳孔立，最近在香港接受專訪時指出，對於臺灣內部政局的演變，大陸不宜採取過多介入和參與態度，應尊重臺灣人民的選擇，而基於臺灣朝野主流政治勢力對一個中國原則的認知，和北京仍有相當差距，兩岸關係在可見時期內，不可能有明顯好轉，即便臺灣內部政局出現新的政黨輪替，兩岸關係也不可能出現具實質意義的改善。
陳孔立認為，江澤民以及錢其琛等北京對臺決策高層的多次重要講話，均表示尊重臺灣人民當家做主的意願，這是實事求是的政策立場表述。體現在對臺灣內部的政治選舉問題上，大陸也應採取明確的不介入立場，既不介入選舉的過程，也不介入選舉的結果﹔大多數臺灣人民選出誰，就要和他打交道。無論臺灣內部選舉結果如何，大陸希望這個結果有利於發展兩岸關係﹔凡有利於兩岸關係發展和兩岸人民切身利益的，都應歡迎和鼓勵支援。只有這樣，才能真正準確把握臺灣主流民意的脈動，真正掌握促進兩岸關係良性互動發展的客觀規律。
對陳水扁當局目前的大陸政策，陳孔立的評價是﹕民進黨“政府”的真正意圖是以“三通”換兩國，希望在涉及“三通”的談判過程中，潛移默化地體現公權力，從而實現所謂“政府對政府”的目的。
陳孔立指出，陳水扁在各種場合中，多次表示了促進兩岸“三通”的意願，一方面是迫於內部社會各界的壓力，另一方面，是為了爭取給二00四年競選“總統”連任增加政治資本，民進黨政府的基本心態是希望談但不願能談成功，談則可為自己加分，但內部對“三通”實際準備不足。
民進黨部分派系及臺聯黨對“三通”仍強烈消極，傳統產業和農漁業對直接三通的反彈很大，失業率將會繼續攀升，對中國大陸經濟的依存度還會提升。儘管臺灣還剩下高新科技產業，希望努力維持兩岸產業佈局的垂直分工，但高新科技產業只是臺灣最後一道防線，當權者不能不面對和考慮兩岸直接三通之後給臺灣社會帶來的諸多負面衝擊。
大陸對“三通”的態度很明確，就是錢其琛講話中強調的“以民為本，為民謀利”，也提出了“民間對民間，行業對行業”的變通方式，但不可能讓“三通換兩國”的圖謀得逞，使未來的兩岸關係發展進一步錯綜複雜化。
陳孔立對兩岸在一個中國原則問題上的認知差距感憂慮。他說，大陸對臺當局須清醒認識到，臺灣朝野各政黨對待一個中國原則的態度是一樣的，無論哪一政黨執政，都難於面對一個中國問題，也不會輕易坐到政治談判席上。
對明年臺灣的總統選舉和連宋配後的臺灣政局，陳孔立抱持謹慎態度。他認為，即使泛藍整合成功，國民黨和親民黨政黨聯盟重新奪回執政權，短期內的兩岸關係也不會有突破，在泛綠陣營牽制下，兩岸關係不是當政者當務之急，因此兩岸關係不至於明顯改善。
