隨著黃岩島事件遲遲未落幕，太平島又起風波；相對於大陸方面的強硬積極，臺灣卻似乎較為消極，不僅對南海主權爭端採取低調以對，更表明不會與大陸共同維護南海主權。這種態度固然有其道理，但從長遠來看恐怕有待商榷。
黃岩島事件錯綜複雜，面對日益嚴峻的局勢，大陸國臺辦發言人表示：“中國對南海諸島及其附近海域，擁有無可爭辯的主權，海峽兩岸都有責任加以維護”；臺灣“陸委會”主委賴幸媛卻聲稱：“南海諸島或是釣魚島，是‘中華民國’固有領土，‘中華民國’不與大陸處理主權爭議。”雙方立場顯然有別。
表面看，擱置主權爭議是臺灣現階段處理兩岸問題的最高指導原則，不過，南海主權之爭並非兩岸之間的對立，而是兩岸與菲律賓、越南等國之間的衝突。臺灣固然可以堅持對這些地區海域的主權，也應該跟大陸繼續就這些領土主權的歸屬擱置爭議，但對於本屬中華民族擁有的南海，兩岸為什麼不能攜手合作，共同維護主權，共同開發資源？
大體而言，臺灣之所以對南海主權爭議一貫採取中立緘默態度，其原因不外有三：第一，南海諸島距臺灣太遠，力有未逮；第二，臺灣將南海議題視為政治範疇，而且屬於並無迫切處理必要的困難問題；第三，一些國家敢於跟大陸嗆聲，無非仰賴美國撐腰，臺灣若與大陸連手捍衛南海主權，形同與美國對抗，這對與美國關係密切的臺灣，顯然是不可承受之重。
這些理由自然可以理解，但也不表示兩岸絕對不能共同處理南海問題。首先，共同捍衛南海並不意味臺灣就要放棄南海主權，就像兩岸已簽訂16項協議一樣，何況兩岸既有求同存異、擱置爭議的共識，為什麼不能在南海議題上合作？其次，只要兩岸宣示共同維護南海主權，任何東盟國家想要挑釁東沙或南沙，就不能不有所顧忌。此外，臺灣一直回避南海爭議，無異使臺灣在競爭南海資源上自失立場，至於臺美關係固然重要，但大陸與美國既對抗又合作，不會因為兩岸共同維護南海主權，就使美國改變其兩岸政策。
總之，無論從政治、經濟或外交立場來看，兩岸都有共同維護南海主權、共同開發南海資源的必要。深盼兩岸擱置爭議、釋出善意，儘速將南海議題納入兩岸協商。
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