臺日簽署漁業協議擴大臺灣漁民捕魚適用範圍，但釣魚島主島12海裏未列入範圍，馬英九16日下午在國民黨中山會報挂保證，臺灣漁船還是可以去那裏捕漁，如果日本海上保安廳干擾，“海巡署”也一定會去護漁。
臺日簽署漁業協議，雙方同意劃設大範圍“協議適用海域”讓臺灣漁民捕魚，若扣掉釣魚島12海裏範圍內，整個區域達7萬4千平方公里，馬英九16日下午主持中山會報肯定“臺日漁業協議”成果，並指出之前16次談判都沒談成，這次第17次能夠談成，因為日本前後任野田內閣及安倍內閣都贊成擴大開放。
對於綠委質疑釣魚島12海裏範圍沒有開放，有損釣魚島主權的說法，馬英九指出，整個捕漁的區域是7萬4千平方公里，協議適用的區域不包括釣魚島周邊的範圍內，但臺灣的漁船還是可以去那裏捕漁，如果日本海上保安廳干擾，“海巡署”還是會去護漁，其他區域也都不會受到干擾，所以這次協議是“釣魚島主權未讓步，臺灣漁權大進步”。
馬英九也強調，臺日雙方也明訂免責條款，所有協議內容不影響政府根據海洋法所做的主張，雙方也決定要常設漁業委員會來解決後續的問題，這對臺灣來講是重要的一步，等於也是一個示範，“東海和平倡議”確有實質效果。
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