臺灣民主自治同盟中央擬在兩會上建議，兩岸海協會和海基會通過積極溝通、協調，建立並健全兩岸經濟合作框架協議（ECFA）運作層面的功能性組織機構，研究、設立互相派駐的常設性、功能性辦事機構。
作為ECFA後續協商的關鍵一步，兩岸經濟合作委員會2月22日在臺灣桃園舉行了首次例會。這份提案表示，設立ECFA大陸駐臺灣工作小組（或辦事處）、ECFA臺灣駐大陸工作小組（或辦事處），便於兩岸雙方在經合會每半年度工作例會的閉會期間，保持實務操作層面常態化的溝通、協商、解決爭端、業務推進等。兩岸互相派駐的工作小組（或辦事處）可分別受海協會、海基會授權，在經合會的監督下，行使各自的實務協調、管理、推進職能。
提案表示，儘快組建兩岸經合會下屬的功能性工作小組，以具體推動兩岸在產業方面的合作。例如：早期收穫清單工作小組、貨品貿易工作小組、服務業貿易工作小組、爭端解決機制工作小組、投資工作小組等。大陸方面由推進實施ECFA的主要政府職能部門或組織的專家參與各相應工作小組，並與臺灣方面的相應參與人員密切溝通、共同合作，推進協議的各項實務性操作。
提案還包括，借鑒臺灣的運作方式，儘早設立大陸地區的“ECFA事務服務中心”。2010年12月29日，臺灣經濟主管部門整合農業、衛生、金融、稅務等部門，成立了“ECFA服務中心”，受理臺灣業者就ECFA各類事務的諮詢服務，包括貨品進出口通關程式、出口貨品原產地證明書發證作業、臨時原產地規則解釋等。
提案建議，根據ECFA的推進實施及業務需求，逐步在相關業務需求量大的省份建立服務中心，為大陸各地涉及ECFA事務的廣大企業、機構、專業人員等提供各類事務性諮詢服務。
