開闢水稻育種新途徑
“今年5月，我們的水稻材料就要在北京實驗田裏試種了，未來有望推廣到更多地方。”說起手頭的工作，余泓眼睛裏都是喜悅。
余泓是中科院遺傳與發育生物學研究所李家洋院士團隊的一員。他說的水稻材料，是該團隊快速從頭馴化的全新水稻品種。去年初，這一成果發表在科學期刊《細胞》上，被業界認為有望開闢一條野生植物馴化新路。
實現水稻育種從“0”到“1”的重要突破
農作物的栽培與人工馴化是農業文明起源的重要標誌。水稻是全球一半左右人口的主糧，往前溯源，它們的祖先都是7000到1萬年前的二倍體（含有兩個染色體組）野生稻，經過了漫長馴化，成為當前栽培的水稻。
過去，科學家在二倍體栽培稻的基礎上，培育出了一系列優異的水稻品種。然而，除了二倍體栽培稻，稻屬還有其他20多種野生植物，按照基因組特徵又可以分成11類，包括6類二倍體基因組和5類四倍體基因組。其中，CCDD基因組異源四倍體野生稻，是將兩套基因組水稻的完整二倍體染色體進行了融合，有天然的雜種優勢，還具有環境適應能力強等優勢。
如何在異源四倍體野生稻基礎上從頭馴化一種全新的水稻？李家洋帶領團隊，瞄準這一新領域，希望培育出產量高、環境適應好的新水稻。
雖然異源四倍體野生稻種質資源優勢明顯，馴化潛力和開發空間大，但它存在一些不足，如種粒小、易脫落、花期短等，這些缺陷使其無法適應農業生產。
受株型、花期、育性等影響，野生稻通過實驗室馴化、改良也面臨重重困難。經過多年攻關，李家洋團隊提出了異源四倍體野生稻快速從頭馴化策略，帶領團隊創制了世界首例重新設計與快速馴化的四倍體水稻材料。這被稱為水稻育種從“0”到“1”的重要突破。
具體來說，馴化策略分為四個階段。在第一階段，該團隊與同行合作，收集了28份異源四倍體野生稻資源。通過深入研究，篩選出一份高稈野生稻資源，並將其命名為多倍體水稻1號。在第二階段，團隊建立了野生稻快速從頭馴化技術體系。在第三階段，進行品種分子設計與快速馴化；第四階段則是推廣應用。
經過對多倍體水稻1號中同源基因進行編輯，團隊成功創制了落粒性降低、芒長變短、株高降低、粒型變長、莖稈變粗、抽穗時間縮短的各種基因編輯材料。這項工作證明，從頭馴化四倍體野生稻在策略上是可行的。
李家洋介紹，團隊計劃用5至10年完成示範材料。之後，再用5年左右培育可用於農業生產的高產優質高抗高效新水稻作物。“應用這一新方法，水稻從頭馴化可能縮短到幾十年甚至幾年。”李家洋表示。
為野生植物重新馴化提供了解決方案
經過漫長的馴化，野生植物中一些符合人類需求的性狀被保留下來，作物的產量更高了，適用種植範圍更廣了，但這一過程也造成了遺傳多樣性的大量減少和一些重要基因資源的丟失。
“營養不夠多施肥，生病了靠打藥，久而久之，農作物很多基因就丟失了，對環境的適應能力隨之下降。”李家洋告訴記者，目前農作物品種更新很快，一些種質資源缺失後就再也找不回來了。
與傳統農業中多樣化品種小規模種植不同，現代農業追求高產，品種的單一化、同質化種植，在削弱了農業生態系統多樣性的同時，還易引發土壤、水污染等問題。
多倍體化是植物最重要的進化事件之一。業內專家表示，二倍體向多倍體演化過程引入了新的遺傳資訊，這一馴化策略有利於保護生物多樣性。由於在作物育種上的貢獻，“異源四倍體野生稻快速從頭馴化獲得新突破”入選2021年度中國十大科技進展新聞。
這項研究的價值不僅在於水稻領域，還對其他植物的快速馴化提供了技術路線參考。李家洋說，實踐證明異源四倍體野生稻快速從頭馴化策略可行，其重要意義在於，它也為遺傳背景複雜的野生植物重新馴化提供了範例和解決方案。
我國人多地少，吃飯問題始終是頭等大事。業內專家表示，突破現有作物改良局限和技術瓶頸，創造符合我國國情、農情的全新作物，引領種子精準設計，對保障我國糧食安全具有重要的意義。
據介紹，無論小麥、燕麥等糧食作物，還是煙草、棉花等經濟作物，許多重要作物都是異源多倍體，它們大多數是天然的異源多倍體物種。但人工誘導異源多倍體作物挑戰重重，由於時間長、耗費大量的人力物力，許多有價值的種質資源沒有得到充分利用。李家洋團隊提出的策略，極大壓縮了作物馴化時間，為農業產值高、遺傳背景複雜、馴化潛力大的野生植物的快速馴化提供了思路。
未來，科學家們還將做進一步的研究，依靠植物基礎科學研究的重大理論創新和技術突破，從頭馴化更多新作物。
突破源於科研人員的長期堅持與深厚積累
2015年，李家洋團隊全面啟動四倍體野生稻研究工作，但相關準備工作很早就開始醞釀。李家洋團隊一直在探索使用新的遺傳學育種方法，水稻只是諸多作物中的一種。
“我們研究的推進，得益於現代生物技術的成熟。”李家洋解釋說，基因組測序組裝、基因組編輯、合成生物學等技術的發展，讓之前做不了或者做起來效率很低的工作變成可能。
11年前，余泓加入李家洋團隊。除了參與每階段具體科研任務，他還承擔團隊協調、溝通工作，見證了研究工作從“0”到“1”的每一步。
“基礎科研從來不會保證產出，每一個階段都可能遇到瓶頸，讓整個研究走不下去。”余泓表示，“團隊自始至終都是在壓力下前行。”
在整個馴化策略階段，李家洋團隊遇到了許多棘手難題。比如，在收集到的四倍體野生稻資源中，到底哪個最有可能成為底盤種質資源？能不能獲得再生能力好的苗？為此，科研人員做了大量的篩選工作。又如，現有栽培稻遺傳轉化方法對野生稻無法適用，科研人員為此建立了野生稻高效遺傳轉化體系；在基因組的繪製和基因功能註釋上，團隊也做了很細緻的處理……攻克這些難題，耗時短的也要一年左右。
項目推進的6年多時間，團隊沒有就相關研究成果發表過一篇文章。“我們的一些階段進展，其實足夠發文章。中間沒有發表論文是為了完整驗證從頭馴化四倍體野生稻的可行性，得出一個真正有價值的結論。事實證明，我們得到了理想的結果。”余泓說。
余泓告訴記者，根據研究階段的需求，團隊會吸納不同專長的科學家參與進來，這項成果是在科研人員的緊密合作、學科交叉融合基礎上取得的。
“我們的執著得到了回報。”余泓說，參照成熟的路徑去研究，過程相對容易，產出也有保障，但很難有原創性。面向未知的探索，才能帶來較高的回報。“團隊做出這項突破，源於科研人員的長期堅持與深厚的積累。一些技術得以突破，背後是十幾年的鑽研。”
按計劃，今年9月，在北京試種的野生稻就要收穫。“我們團隊都在期待一個好結果。”余泓說。
