吉林大學校長展濤等人指出，大陸對 與臺灣開展教育交流與合作持積極鼓勵的態度，１９８５年，大陸就放開臺灣學生報考大陸高校。２００６年，又宣佈開放承認臺灣學歷。２００７年，教育部有關負責人宣佈歡迎臺灣院校到大陸招生。２００７年，大陸高校招收臺灣學生２２３５名，在校的臺灣學生達到６８５８人。兩岸有４００多所高校簽署了交流協議，每年有２０００至４０００名臺灣學生到大陸考大學，報考碩士、博士的臺灣學生呈現持續增長的態勢。

    但另一方面，受複雜因素的影響，從１９９８年至２００７年，臺灣在對大陸開放教育交流與合作方面，卻明顯滯後，連早期頒布的《大陸地區學歷檢核及採認辦法》也全面擱淺。廈門大學臺灣研究院張寶蓉博士說，從２００８年開始，臺灣開始放鬆限制，但又採取“三限六不”政策：限制承認大陸高校數量、限制陸生來臺數量、限制醫師學歷承認；大陸學生來臺考試不加分、不提供獎學金、不許到校外打工或兼職、不能享受健康保險、不能報考專業證照、畢業後不能繼續留在臺灣就業。這個政策受到兩岸許多人士的質疑。

    兩岸不少學者認為，產生上述現象的原因，既有政治因素，也有人為顧慮。臺灣國政研究基金會教育文化組召集人李建興認為，在全球化的時代，高等教育已經成為一個高度競爭的領域。教育的專業化、國際化、自由化已經成為成為無可避免的趨勢。大陸和臺灣只有強化和深化學術內涵，拓展學生的視野，才能在國際競爭中取得優勢地位。李建興認為，在海峽兩岸深化和拓展教育交流與合作，對兩岸學生而言，可以選擇適才適所的學校就讀，可以獲得多元化的升學和進修管道。對學校而言，可以調節供需失調，促進學校發展。目前臺灣各大高校，生源不足，招生困難；而大陸高校，供不應求，每年有數百萬學子望高校之門興嘆，選擇開放，適當調節，對兩岸高校都有利。對企業而言，可以通過兩岸教育交流和相互採認學歷，擴大企業的選材範圍，增強企業的“體質”，增加企業產學合作的機會，有利於新產品特別是高科技領域的創新和開發。對社會而言，則能提高兩岸民眾素質，解決民眾因婚姻或就學伴隨而至的升學與就業問題。此外，兩岸學生往來就學，在學習中增進對彼此生活、制度和價值觀的了解，有助於消除歧見，對兩岸長久和平發展非常有利。

    廈門大學臺灣研究院張寶蓉博士通過研究還發現，臺灣開放高校赴大陸招生，有利於解決臺灣高等教育經費投入不足的問題。她說，近些年，臺灣教育經費投入佔ＧＤＰ的比例，連年走低，已經從２００１年的６．０９％降至５．７６％。２００８年，受全球金融危機的影響，臺灣高等教育公務預算經費維持在７６．８億元新台幣的低位，２００９年高等教育行政和督導預算經費只有１１．７３億元新台幣。如承認大陸學歷、開放大陸招生，還可以在相當程度上減輕臺灣高校的財務負擔。