順應兩岸“大三通”新形勢，福建檢驗檢疫部門在對臺小額貿易監管、閩臺直航船舶、臺灣農產品檢驗等方面已開始推出多項新措施，大力促進閩臺交流合作。
福建檢驗檢疫部門十二日在此間向記者透露，兩岸“三通”時代開啟，該局正加強形勢政策研究，創新對臺小額貿易監管制度，對閩臺直航船舶推廣應用電子申報，加強臺灣農產品檢驗檢疫風險預警及後續除害處理研究，以更好地服務和促進閩臺交流合作。
據介紹，因應兩岸“大三通”新形勢，福建檢驗檢疫部門採取的新舉措包括：主動開展前瞻性、全方位的形勢、對策研究，深入開展涉臺檢驗檢疫工作調研，立項《福建涉臺檢驗檢疫狀況與對策研究》課題。擴大電子檢疫，實行人等船、船到卸貨和出入境一次申報等措施。簡化對臺小額貿易檢驗檢疫手續，實行到貨現場快速檢驗檢疫和監管倉庫集中查驗等措施，優化對台貿易的“三C”免辦證明手續，做到當天受理當天發證。
在臺灣農產品檢驗檢疫風險預警及後續除害處理研究方面，福建已初步完成臺灣柑橘、芒果、香蕉、蓮霧、木瓜、番石榴、鳳梨等七種水果有害生物風險分析，初步提出主要針對臺灣水果桔小實蠅的除害處理技術指標，並初步完成臺灣水果農藥殘留快速檢測技術標準的制定。
