李遠哲表示，從科學觀點來看，目前95%核原料發電的能量最後會變成核廢料，是相當不理想的情況，但從降低二氧化碳排放量的觀點，核能發電有正面之處。

　　不過他指出，核能發電最大問題卻不在此處，推動核能發電是政府怎麼做的問題，不能把某個技術排除在外。

　　他表示，臺灣有3個核能廠，第4個也快要啟動，有些核能發電廠已興建、土地已污染，應儘量好好利用，但核能發電還有很大的進步空間；現在很多人研究燃料用到最後可不產生污染而且安全，若如此，反對核能發電者應會減少。

　　李遠哲認為，他以前講過贊成非核家園，但非核不是本世紀前50年可做到的，核能發電將是一個過渡技術，非核家園可能到了這個世紀後半葉可以做到。他強調，政府應儘速提升能源效率、民眾應儉樸生活。

　　他表示，陽光、海流、風力等再生能源，每個都有各自的問題，哪些再生能源適合臺灣發展、該如何運用臺灣的土地等，需要仔細評估，也需要大家討論。

　　李遠哲表示，政策很重要，不應盲目相信再生能源可達到降低二氧化碳排放量的目標，臺灣是能源輸入地區，應透過國際合作解決能源問題，否則即使臺灣遍地都是核電廠，也不能滿足臺灣的需求。