改革對象越多元，越需要理順體制；改革局面越複雜，越需要不斷創新。
《關於分類推進事業單位改革的指導意見》提出，以科學分類為基礎、以深化體制機制改革為核心推進事業單位改革。這抓住了事業單位改革面臨的共性問題，提出了切實可行的解決辦法，是進一步強化事業單位公益屬性、進一步促進公益事業又好又快發展的堅實基礎和有力保證。
目前，一些事業單位不同程度存在偏離公益目標、生機活力不足等問題。這些問題，根子在體制機制。或是政事不分，事業單位履行行政職能，成為“二政府”；或是事企不分，事業單位從事生產經營，成為“二企業”。在管理上，也存在管辦不分、監管缺位的問題，政府部門對事業單位要麼管得過多過細，要麼沒有管理到位。
這些體制機制上的問題，既削弱了事業單位的公益屬性，也影響了政府職能有效履行和市場公平競爭。如果不進一步轉變體制、轉換機制，就無法促進政事分開、事企分開，無法完善管辦分離、監督管理，也就無法激發事業單位的生機與活力。
體制機制是管全局、管長遠的根本所在。事業單位能否健康發展、公益屬性能否得到強化，體制機制創新是關鍵；事業單位改革能否切實取得成效，公益事業能否不斷發展壯大，體制機制創新是要害。如何厘清不同單位性質，實施有針對性的改革和管理？如何完善管理方式，進一步激發事業單位的內在活力？如何引入社會力量，進一步提升公益服務的品質和效率？這些，都考驗著改革者的決心、智慧和勇氣。
只有明確改革對象，才能更好地創新體制機制，完成事業單位改革新使命。按照不同的社會功能，現有事業單位可劃分為“三大類”。對承擔行政職能的，逐步將其行政職能劃歸行政機構或轉為行政機構；對從事生產經營活動的，逐步將其轉為企業；對從事公益服務的，繼續將其保留在事業單位序列、強化其公益屬性。從事公益服務事業單位的改革，是分類推進事業單位改革的重中之重。
只有抓住關鍵環節，才能不斷地創新體制機制，回應公益事業發展新命題。要推進政事分開，逐步減少行政主管部門對事業單位的微觀管理和直接管理，積極探索管辦分離的有效實現形式；著力探索建立多種形式的法人治理結構，使服務對象和其他方面的代表進入事業單位理事會並直接參與決策，進一步落實事業單位法人自主權，確保事業單位的公益屬性。同時，進一步深化事業單位機構編制、人事制度、收入分配、社會保險等方面的改革，完善財政政策，加強事業單位黨的建設。
能不能形成一套合理的事業單位管理體制和運作機制，是改革成功與否的重要標誌。不從根本上改革事業單位管理體制，切實解決影響公益事業發展的深層次問題，只是把發展公益事業簡單地理解為增設機構、增添人手、增加投入，公益服務品質和效率就難以真正提高，公益事業的投入效益就會打折扣，甚至可能“打水漂”。
檢驗事業單位改革舉措的標準，是能不能強化公益屬性、激發生機活力、促進公益事業發展。打好科學分類這個基礎，抓住創新機制這個核心，事業單位改革一定能順利推進，改革的總體目標就一定能夠實現，切實滿足人民群眾和經濟社會發展對公益服務不斷增長的需求。
