臺灣《中國時報》報道，陳水扁申請重回民進黨，因爭議過大，受理的臺北市黨部29日以“徑送中央”的方式，表達拒審態度。對此，民進黨發言人王閔生表示，依程式而言，入黨都必須經過地方初審，所以未來還是會“依照程式處理”。扁申請入黨案，成了“另類人球”，在地方及中央之間被踢來踢去。
面對扁入黨引發的爭議，綠營甚至有人直指此舉將衝擊大選，對此，29日蘇貞昌親上火線捍衛扁的權益說，每個人對扁都有不同的看法，但其實扁自己做了什麼事，“他自己都講過了”；所以，今天的入黨申請，一切就按照程式走；至於是否會對選情造成衝擊？他強調，“不要有太多算計，要多點人性”。
對於外界質疑扁從未就自己所犯的錯向社會道歉，蘇貞昌則強調，扁在2008年的退黨記者會上，其實就已經向社會作出表達；尤其，扁已經被關了這麼久，國民黨又不斷地進行司法操弄，所以才會有逾6成的臺灣民眾支援讓他保外就醫。
依民進黨規定應召開“入黨審查會議”，儘速審理扁入黨的民進黨臺北市黨部，29日上午先由主委莊瑞雄發函黨中央，詢問目前人被移往臺中培德病監的扁，戶籍地是否還在臺北市；而且2008年民進黨廉政會對扁做出“視同除名”的決議，是否還有效。
莊瑞雄說，由於扁的入黨屬於高度爭議性，地方黨部實在無法說“yes or no”，為避免無謂的紛爭，所以他還是決定將案子直接徑送民進黨中央的復審小組做決定。
面對地方黨部連“形式審查”都不願意做，讓黨中央相當棘手。下午，旋即由黨秘書長林錫耀邀集組織部主任李文忠等人，就程式問題進行了解。
事後，王閔生解釋，由於入黨申請必須先經過地方初審，才能進入中央復審，所以未來還是得“依程式處理”。
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