臺灣《兩岸商情》雜誌披露了謝長廷訪問大陸的幕後秘聞，雜誌稱，謝長廷早在12年前就已考慮登陸，但被當政的陳水扁打斷，直到近期才成行。全文如下：
回憶起2000年六、七月間，時任高雄市長謝長廷要訪問廈門的消息公佈，引起了兩岸媒體普遍關注，就在最後時刻他卻突然取消訪問廈門之行，據悉，當時的領導人陳水扁從中阻撓，才讓這旅程最終擱淺。
根據《兩岸商情》于2012年03月號“兩岸聚焦”報道中說道，就在上世紀90年代末，臺灣前後兩位領導人先後宣示等言論：李登輝拋出“兩國論”，陳水扁推波助瀾急下端出“一邊一國”等論調，頓時讓兩岸間陷入了冰點，此時的謝長廷也在思緒著，該如何打破兩岸僵局？
破冰之旅 謝市長願扮急先鋒
2000年6月，出於高雄經濟發展需要的考慮，當時的謝長廷提出，以高雄市的官方名義到大陸訪問。那時，謝長廷不僅是臺灣大市的市長，而且馬上就要接任民進黨主席，是臺灣政治臺面上的重量級人物，尤其此前尚無臺灣現任重要官員“登陸”的先例，若實現此行，無疑是一次突破。它會以兩岸城市間的互動打破兩岸關係僵局的效應，所以謝的舉動備受社會和大陸方面的重視。
透過當時媒體報道了解到，6月27日上午，謝長廷還在臺召開記者會，宣佈將以高雄市政府名義邀請，包括廈門在內的大陸重要港口城市市長互訪。6月28日，高雄市秘書處將三封希望與廈門交流的信函傳真至福建省政府。
廈門和有關方面對此作出了積極響應，為促成此事進行專門研究，對相關工作作具體部署。為了打破臺當局“兩國論”對高雄、廈門兩市互訪的障礙，謝長廷表示將公開表明高雄與廈門是“一個國家的兩個城市”。廈門及有關方面也一直等待謝作這一“表明”之後，以朱亞衍市長的名義向謝發出邀請函，邀請其來廈訪問。
據說2000年7月3日，廈門擬發出邀謝訪廈函的這一天，一直等謝的這一“表明”，但卻遲遲未見。高雄方面說謝去了臺北辦事，晚上才能回高雄，讓人不明就裏。直到深夜，終於傳來謝長廷在臺灣《今日報》上作這一“表明”的資訊。謝明確指出，依“法源”，高雄和廈門是一個國家的兩個城市。於是時任廈門的邀請函終於發出。
扁當局百般阻撓擱淺
廈門邀請函發出後，也立即收到謝長廷以高雄市市長名義，邀請時任廈門相關官員訪問高雄的信函，一切看似按原計劃有條不紊地進行著，只等著7月10日至13日謝長廷到訪。
其實，為了推動兩岸關係發展，促成此次兩市互訪，廈門市做了大量相關準備的工作，謝長廷來廈的接待、朱亞衍赴高雄訪問安排等都相應形成方案，內容包括雙方會面、商談議題和參觀考察行程。
當時對這次參訪的定調是兩市間的文化與經貿交流，以此促進兩地文化經貿合作往來，逐漸建立帶有“兄弟市”性質的交流合作關係。同時希望通過城市間互動往來，推動兩岸關係緩和發展。
“可惜的是，在陳水扁當局阻撓下，謝長廷廈門之行終究沒有成行，這確實是非常遺憾的事情。”參加兩市互訪準備工作的原廈門市臺辦主任孔長才說。
7月7日下午，謝長廷在行政院召開記者會宣佈，由於陸委會對高雄市政府訪問廈門市計劃的疑慮，無法在一兩天內消除，他只好取消這項“破冰之旅”，併發表“深化臺灣價值，突破兩岸困境”的聲明。
事後有評論指出，陳水扁當時之所以阻撓謝長廷廈門行，是怕他“搶走自己的光環”。
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