在臺灣媒體看來，福建自貿區屬於“2.0版自貿區”，不僅是大陸經濟再平衡的新櫥窗，也是對臺深度經濟合作的一張王牌，將對臺資產生難以抵擋的磁吸效應。
臺灣《旺報》指出，大陸正在調整經濟結構，“2.0版自貿區”被視為大陸經濟再平衡新櫥窗。臺灣全球運籌協會秘書長王亮建議臺商好好利用福建自貿區進行產業對接，臺灣可進口原料、加工半成品，再到福建加工為成品，作為進入大陸市場和出口國際市場的跳板。
臺灣《經濟日報》也引用臺商的事例說明，從臺灣進口食品到福建自貿區，再分裝運到其他省份，比從其他地方整整省下50%的成本。該報道說，由於服貿協議一直沒在臺灣通過，很多臺商怕影響大陸佈局，搶著進駐福建自貿區，掛牌當日就有6家臺商進駐。推進對臺深度合作一張王牌臺灣經濟研究院院長、臺大經濟係教授林建甫在網路媒體撰文分析說，福建自貿區隔着海峽與臺灣相望，挾地理優勢和閩臺之前的傳統合作基礎，將是推進對臺深度合作的一張王牌。
他認為，由於臺灣正位於“海上絲綢之路”的關鍵點，大陸沿海的自貿區特別是福建自貿區，恐將會形成更強大的磁吸作用，吸引臺商不得不與之進行更深度和更大範圍的經貿合作。臺灣應借力使力，搭順風車，爭取最大利益。
淡江大學財務金融係教授李沃墻在《旺報》發表時評稱，臺商若能把握契機，自然享受許多商機。看看大陸“一帶一路”大戰略以及亞投行、滬港通所帶來的龐大資金潮，便可知大陸誘人的吸引力。臺灣應正視這股磁吸效應，加速開放及參與，否則難逃經濟衰退處境。
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