香港《亞洲週刊》今年37期刊文說，馬英九在臺當局行政團隊全面改組前，已秘密徵詢針對情報組織系統再造的意見。很明顯，在這波人事改組後，馬英九將主導情報系統的精簡，並在兩岸關係改善的前提下，軍情系統的針對性也會一併調整。馬英九的軍方智囊認為，兩岸關係逐步化解，已經趨向友善，對大陸的情報蒐集功能也逐步降低，情報部門的“編制”應一併和軍方組織精簡通盤考慮。
文章摘編如下:
臺灣政壇出現大地震，在馬英九的強勢主導下，“總統府”、“行政院”和國民黨的人事大改組，國民黨中生代接班梯隊成形，馬英九更為2012年連任，組成“戰鬥內閣”，而在這波重組中，軍情系統的全面改造也悄悄的進入了馬英九的執政日程中。
據國民黨高層人士表示，在八月中旬，馬英九就特別找了他的軍事幕僚進入“總統府”徵詢，馬對於“國防部”一年多以來，在推動“國防組織法”的進度頗為不滿。
馬英九在內部討論時強調，現今兩岸關係和緩，臺灣必須進一步裁軍，這是推動“募兵制”最好的時機，很顯然“國防部”在這方面並沒有完全落實它的構想。
馬英九在當天還聽取當局內部建言，在下階段將再度精簡軍方人事，並全力推動“合署辦公”，把“參謀本部”的組織再精簡，等同於把軍方的組織系統做一番大調整。讓軍方仍然過於龐大的組織再一步“縮編”，以回應兩岸關係的新趨勢，並配合“募兵制”的實施，兵員的額度和軍官員額都會進一步裁減。
在這場私下的徵詢中，還提及“國安局”的功能已大幅縮減，但是，“國安局”擁有的將官員額太多，必須進一步“縮編”以響應整體組織精簡。
據臺“國安局”高層人士表示，“國安局”擁有的將官員額是各單位中最多的，“局”本部各處處長、研究委員、室會主任、各中心主任、副主任，再加上派外的特派員站主任及“局長”“副局長”等。
加總起來，在軍方全力減少將官的壓力下，“國安局”等同於化外之民，仍然擁有眾多將軍名額。“國安局”將官“簡編”，已是早晚要發生的事。
馬英九的軍方智囊認為，兩岸關係逐步化解，已經趨向友善，對大陸的搜情功能也逐步降低，“國安局”的“編制”也應一併和軍方組織精簡通盤考慮。
尤其是，“國安局”近幾年的情報能力已大不如前，必須將規格重新調整，以符合未來兩岸新局面的需要。
馬英九在“內閣”全面改組前，已秘密徵詢針對情報組織系統再造的意見。很明顯，在這波人事改組後，馬英九將主導情報系統的精簡，並在兩岸關係改善的前提下，軍情系統的針對性也會一併調整。
為因應馬英九主導的兩岸開放政策，臺灣軍情系統、防務系統把大陸當作唯一的假想敵的時代將逐步走入歷史。
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